故宫收藏的宗教文物有汉传佛教、藏传佛教、道教、萨满教文物四大类。汉传佛教文物以清宫旧藏的各种佛教经典为主，以及故宫博物院成立后入藏的各类佛教造像。道教文物五百多件存于钦安殿、玄穹宝殿两处殿堂，供奉道教的神像、供器、法器、经书。萨满教文物存于坤宁宫西暖阁，有萨满祭祀仪式所用的神像与道具等几十件。故宫的道教、萨满教文物一直在原来的存放的地，文物与古建未脱离，保存了大量的原始信息，具有比一般传世文物更高的历史文化价值。藏传佛教文物占宗教文物总数的百分之九十以上，原存于清宫多处藏传佛堂，这些文物在佛堂内一切维持原样，反映了宗教建筑与文物组合的整体空间，藏传佛教的文物大部分来源于清代蒙藏地区的民族宗教领袖进献皇帝的珍贵礼物以及内地宫廷所造的佛教艺术精品，其中还包括有不少来自印度、尼泊尔的域外佛教艺术精品。它们显示了藏传佛教艺术的辉煌成就，另一方面从历史的角度反映了清代中央政府与西藏的紧密关系和清朝治理蒙藏边疆的历史进程。