清宫早期的书房除举经筵的文华殿外,全部分布于保和殿、乾清宫、养心殿三区,且皆为政寝合一的建筑,即皇帝的寝室、起居室、书房与召见大臣商议军国大计之处都集中于一个建筑区域。保和殿主要为顺治朝使用,乾清宫区在康熙朝发挥功能最大,养心殿区则自雍正朝起始渐成为勤政的皇帝们最主要的活动区域。
紫禁城中书房大量增设的时期是在乾隆朝,乾隆皇帝外收天下图书,内建楼阁苑囿,并时常举行大型的文事活动,甚至可以说弘历所到之处必设书房。至乾隆朝,紫禁城的书房规模大备。弘历少时居住的乾西二所因是“潜龙邸”,升为重华宫,其中有“乐善堂”、“长春书屋”、“抑斋”、“古香斋”等精致考究的书房。乾隆帝即位后兴起了空前的图籍收集和编纂事业,紫禁城中的图书更是汗牛充栋。其中最大的藏书处当然是文华殿后那座瓦顶墨黑的文渊阁,此外弘历又命撷《四库全书》之精华,编成“荟要”,陈于御花园的摛藻堂内,以便取携观览。乾隆皇帝还为他极珍视的书籍碑帖单独辟出书房,例如:昭仁殿中有陈列宋、金、元、明刊版图书的“天禄琳琅”,宋代岳珂刊刻的“五经”集全后又专贮于昭仁殿之“五经萃室”;宋徽宗赵佶所书《毛诗》和马和之奉命绘制的《毛诗全图》藏于景阳宫后御书房,乾隆皇帝为书房题匾:“学诗堂”;丙申年(乾隆四十一年,1776年)后集获之书藏于御花园的养性斋;《钦定古今图书集成》曾经收贮于重华宫区内的“古香斋”。还有收藏法帖的“三希堂”、收藏《石渠宝笈》所著录之书画的“画禅室”等等。弘历年入耆龄之后,开始大兴土木,在宫内兴修园林,西造建福宫花园,东建宁寿宫花园,东西两大花园形成对称局面。这些花园内配合置景又添设了许多休闲性质的书房。而宁寿宫区的养性殿又是对应内廷的养心殿仿建的,甚至其中的书房也作对应设置,如以“墨云室”的“含英咀华”之意对应“三希堂”之“内圣外王”之内涵。自命风雅的乾隆皇帝主宰紫禁城六十余年,所以紫禁城中大多数书房都留有他的遗韵。